Скунсовые (семейство Mephitidae) произошли, как и другие представители отряда хищных (Carnivora) подотряда собакообразных (Caniformia), от палео-эоценового семейства миасовых (Miacidae), но ни в палеоцене, ни в эоцене останки скусновых в настоящее время не обнаружены. Самые ранние находки представителей данного семейства датируются не раннее, чем поздним (верхним) миоценом (Ромер, 1966, Симпсон, 1945).
Окаменелые останки представителей семейства скунсовых найдены в верхнем миоцене - верхнем плиоцене Европы, нижнем плиоцене - голоцене Азии, нижнем плиоцене - голоцене Северной Америки и плейстоцене и голоцене Южной Америки. В настоящее же время они обитают в основном в Северной и Южной Америках, а также в Юго-Восточной Азии (два вида рода Mydaus (вонючие барсуки, которых благодаря молекулярным исследованиям включили в семейство скуновых в 1997-ом году).
Самая рання находка типового вида семейства - полосатого скунса (Mephitis mephitis) обнаружена в бланкском ярусе (один из ярусов плиоцена - 4,750 тысяч по to 1,808 тысяч лет назад) фауны Бродвотер (Небраска, США).
До сравнительно недавнего времени скунсов помещали в семейство куньих (Mustelidae), однако молекулярный анализ показал, что на самом деле скунсы ближе к семейству малопандовых ((Ailuridae - также относительно недавно выделенное семейство), нежели к куньим, благодаря чему учёные выделили скунсов в отдельное семейство в рамках отряда хищных и подотряда собакообразных.
В настоящее время в семействе скунсовых выделяют 12 видов, распределённых в 4 рода - центральный род Mephitis (полосатые скунсы), Spilogale (пятнистые скунсы), Conepatus (свиноносые скунсы) и единственный современный азиатский род Mydaus (вонючие барсуки).
